Из поселения в оккупированный Ленинград выезжали грузовики с провизией и вооружением. Сюда же направлялись машины с бежавшими от войны горожанами. В этот период в церкви было размещено лечебное учреждение.
В XIX веке Церковь Святителя Николая Чудотворца помимо религиозной функции выполняла и навигационную функцию по Ленинградской области. Благодаря тому, что в крест купола были вставлены хрустальные сферы, она служила своеобразным маяком. Солнечный свет отражался от хрусталя, тем самым ориентируя потерявшихся на Ладоге рыбаков.
Кобона расположена в 150-ти километрах от Петербурга. Однако история поселения начинается задолго до возникновения «северной столицы». Первоначальные сведения о Кобоне датированы началом XVI века, но, возможно, люди проживали здесь и до этого времени. Население к моменту первого летописного упоминания в деревне было русскоязычным.
В 1726 году Кобона стала частью Староладожского канала. Вблизи поселения построили шлюз и гавань. В это время селение находилось во владении графа Б.Х. Миниха. При нем было отстроено деревянное сооружение дворцового типа, в котором принимали правящую тогда Анну Иоанновну. Царствующая особа приехала на торжественное открытие канала в мае 1732 года. Два раза в Кобоне останавливалась и императрица Екатерина Вторая.
В 1788 году поселок стал собственностью чиновника и ученого А. И. Мусина-Пушкина.
В XVIII веке в деревне была возведена церковь Святителя Николая Чудотворца с пятью главами, приделами и колокольней. В 1815 году деревянная постройка сгорела и богослужения стали проводить во дворце, в котором некогда гостила Анна Иоанновна. Новый храм, теперь уже каменный, был воздвигнут в 1821 году.
Несколько десятилетий каменная церковь существовала в первозданном состоянии. Затем, в 1861 году была перестроена. Во время реконструкции увеличили храмовое пространство и убрали приделы.
В 30-е годы XX века храм переоборудовали под складское помещение. Он уцелел во время войны. Однако ввиду неподобающего использования в последующие годы стал ветшать. Снова колокола церкви Святителя Николая Чудотворца зазвенели только в конце 90-х годов.
До деревни Кобона можно добраться автобусом от ст. метро «Улица Дыбенко» или автомобилем по Мурманскому шоссе до деревни Дусьево, а затем поворот налево на Кобону.